Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SYNGR3O43761 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms