Protein–RNA interactions for Protein: O43741

PRKAB2, 5'-AMP-activated protein kinase subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAB2O43741 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PRKAB2O43741 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PRKAB2O43741 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms