Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ACTN4O43707 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ACTN4O43707 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms