Protein–RNA interactions for Protein: O43663

PRC1, Protein regulator of cytokinesis 1, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRC1O43663 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRC1O43663 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRC1O43663 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRC1O43663 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PRC1O43663 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PRC1O43663 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRC1O43663 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRC1O43663 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRC1O43663 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRC1O43663 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms