Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DCXO43602 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
DCXO43602 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DCXO43602 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DCXO43602 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DCXO43602 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DCXO43602 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DCXO43602 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms