Protein–RNA interactions for Protein: O14543

SOCS3, Suppressor of cytokine signaling 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS3O14543 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SOCS3O14543 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
SOCS3O14543 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms