Protein–RNA interactions for Protein: O00370

LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
O00370 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
O00370 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
O00370 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
O00370 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
O00370 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
O00370 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
O00370 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
O00370 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.16
O00370 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
O00370 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
O00370 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
O00370 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
O00370 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms