Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SMAPO00193 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAPO00193 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAPO00193 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAPO00193 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SMAPO00193 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
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