Protein–RNA interactions for Protein: O00161

SNAP23, Synaptosomal-associated protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP23O00161 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SNAP23O00161 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SNAP23O00161 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms