Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SRRM4A7MD48 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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