Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
USP27XA6NNY8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
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USP27XA6NNY8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP27XA6NNY8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
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