Protein–RNA interactions for Protein: A6NFD8

HELT, Hairy and enhancer of split-related protein HELT, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELTA6NFD8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HELTA6NFD8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms