Protein–RNA interactions for Protein: A6NDK9

GOLGA6C, Golgin subfamily A member 6C, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6CA6NDK9 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GOLGA6CA6NDK9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GOLGA6CA6NDK9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms