Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
KLHL33A6NCF5 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
KLHL33A6NCF5 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms