Protein–RNA interactions for Protein: A6NCC3

GOLGA8O, Golgin subfamily A member 8O, humanhuman

Predictions only

Length 632 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8OA6NCC3 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
GOLGA8OA6NCC3 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GOLGA8OA6NCC3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms