Protein–RNA interactions for Protein: A4FU69

EFCAB5, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCAB5A4FU69 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
EFCAB5A4FU69 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
EFCAB5A4FU69 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
EFCAB5A4FU69 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms