Protein–RNA interactions for Protein: V9GYV3

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYV3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYV3 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
V9GYV3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYV3 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
V9GYV3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYV3 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
V9GYV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYV3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYV3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYV3 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
V9GYV3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYV3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYV3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYV3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
V9GYV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYV3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYV3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
V9GYV3 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYV3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYV3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYV3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYV3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
V9GYV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYV3 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
V9GYV3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYV3 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
V9GYV3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYV3 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYV3 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
V9GYV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
V9GYV3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYV3 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYV3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYV3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
V9GYV3 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYV3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYV3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYV3 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
V9GYV3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYV3 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
V9GYV3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYV3 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
V9GYV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYV3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
V9GYV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
V9GYV3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYV3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYV3 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
V9GYV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYV3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
V9GYV3 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYV3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYV3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
V9GYV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYV3 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
V9GYV3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYV3 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYV3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYV3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
V9GYV3 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYV3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYV3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
V9GYV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYV3 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
V9GYV3 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
V9GYV3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
V9GYV3 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
V9GYV3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
V9GYV3 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
V9GYV3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
V9GYV3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V9GYV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V9GYV3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V9GYV3 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
V9GYV3 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
V9GYV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
V9GYV3 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
V9GYV3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
V9GYV3 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYV3 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYV3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
V9GYV3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYV3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
V9GYV3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYV3 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYV3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYV3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
V9GYV3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms