Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R0

NUMBL, Numb-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 609 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBLQ9Y6R0 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NUMBLQ9Y6R0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NUMBLQ9Y6R0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
NUMBLQ9Y6R0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NUMBLQ9Y6R0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NUMBLQ9Y6R0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUMBLQ9Y6R0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUMBLQ9Y6R0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms