Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D6

ARFGEF1, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,849 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF1Q9Y6D6 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
ARFGEF1Q9Y6D6 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
ARFGEF1Q9Y6D6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
ARFGEF1Q9Y6D6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.4■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
ARFGEF1Q9Y6D6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.31■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
ARFGEF1Q9Y6D6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ARFGEF1Q9Y6D6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
ARFGEF1Q9Y6D6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms