Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SF3B6Q9Y3B4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SF3B6Q9Y3B4 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SF3B6Q9Y3B4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SF3B6Q9Y3B4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SF3B6Q9Y3B4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SF3B6Q9Y3B4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SF3B6Q9Y3B4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms