Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
TMED5Q9Y3A6 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
TMED5Q9Y3A6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TMED5Q9Y3A6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TMED5Q9Y3A6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TMED5Q9Y3A6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
TMED5Q9Y3A6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TMED5Q9Y3A6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms