Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y397

ZDHHC9, Palmitoyltransferase ZDHHC9, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC9Q9Y397 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC31.19■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
ZDHHC9Q9Y397 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
ZDHHC9Q9Y397 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC31.07■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.06■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
ZDHHC9Q9Y397 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
ZDHHC9Q9Y397 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
ZDHHC9Q9Y397 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ZDHHC9Q9Y397 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
ZDHHC9Q9Y397 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC30.72■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ZDHHC9Q9Y397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZDHHC9Q9Y397 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
ZDHHC9Q9Y397 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
ZDHHC9Q9Y397 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms