Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2L9

LRCH1, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 728 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH1Q9Y2L9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
LRCH1Q9Y2L9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
LRCH1Q9Y2L9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LRCH1Q9Y2L9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LRCH1Q9Y2L9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LRCH1Q9Y2L9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LRCH1Q9Y2L9 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRCH1Q9Y2L9 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms