Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2I6

NINL, Ninein-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINLQ9Y2I6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.97■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC36.96■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
NINLQ9Y2I6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC36.91■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC36.89■■■■□ 3.5
NINLQ9Y2I6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC36.88■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.87■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC36.86■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
NINLQ9Y2I6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC36.81■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.8■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.79■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
NINLQ9Y2I6 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC36.74■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
NINLQ9Y2I6 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.67■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
NINLQ9Y2I6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.45
NINLQ9Y2I6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
NINLQ9Y2I6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NINLQ9Y2I6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms