Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SSX2IPQ9Y2D8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SSX2IPQ9Y2D8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SSX2IPQ9Y2D8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SSX2IPQ9Y2D8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SSX2IPQ9Y2D8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SSX2IPQ9Y2D8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms