Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y279

VSIG4, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG4Q9Y279 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VSIG4Q9Y279 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
VSIG4Q9Y279 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
VSIG4Q9Y279 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
VSIG4Q9Y279 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
VSIG4Q9Y279 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
VSIG4Q9Y279 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms