Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y244

POMP, Proteasome maturation protein, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POMPQ9Y244 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
POMPQ9Y244 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
POMPQ9Y244 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
POMPQ9Y244 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
POMPQ9Y244 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POMPQ9Y244 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
POMPQ9Y244 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
POMPQ9Y244 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms