Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNZ2

NSFL1C, NSFL1 cofactor p47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFL1CQ9UNZ2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NSFL1CQ9UNZ2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
NSFL1CQ9UNZ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
NSFL1CQ9UNZ2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
NSFL1CQ9UNZ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
NSFL1CQ9UNZ2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.03■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
NSFL1CQ9UNZ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC32.97■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
NSFL1CQ9UNZ2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
NSFL1CQ9UNZ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.6 ms