Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CAPN11Q9UMQ6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
CAPN11Q9UMQ6 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CAPN11Q9UMQ6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CAPN11Q9UMQ6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CAPN11Q9UMQ6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CAPN11Q9UMQ6 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CAPN11Q9UMQ6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CAPN11Q9UMQ6 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms