Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EPDR1Q9UM22 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EPDR1Q9UM22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EPDR1Q9UM22 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EPDR1Q9UM22 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
EPDR1Q9UM22 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
EPDR1Q9UM22 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms