Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULH4

LRFN2, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 789 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN2Q9ULH4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
LRFN2Q9ULH4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
LRFN2Q9ULH4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
LRFN2Q9ULH4 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
LRFN2Q9ULH4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.89■■■□□ 2.22
LRFN2Q9ULH4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
LRFN2Q9ULH4 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
LRFN2Q9ULH4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRFN2Q9ULH4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
LRFN2Q9ULH4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms