Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJV3

MID2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase MID2, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MID2Q9UJV3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
MID2Q9UJV3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
MID2Q9UJV3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MID2Q9UJV3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MID2Q9UJV3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MID2Q9UJV3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
MID2Q9UJV3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
MID2Q9UJV3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms