Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
FOXD3Q9UJU5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
FOXD3Q9UJU5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXD3Q9UJU5 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FOXD3Q9UJU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FOXD3Q9UJU5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FOXD3Q9UJU5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FOXD3Q9UJU5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms