Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ68

MSRA, Mitochondrial peptide methionine sulfoxide reductase, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSRAQ9UJ68 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MSRAQ9UJ68 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MSRAQ9UJ68 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
MSRAQ9UJ68 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MSRAQ9UJ68 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
MSRAQ9UJ68 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
MSRAQ9UJ68 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.95■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
MSRAQ9UJ68 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
MSRAQ9UJ68 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms