Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TMEFF2Q9UIK5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TMEFF2Q9UIK5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEFF2Q9UIK5 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TMEFF2Q9UIK5 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEFF2Q9UIK5 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEFF2Q9UIK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEFF2Q9UIK5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms