Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SS18L2Q9UHA2 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SS18L2Q9UHA2 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SS18L2Q9UHA2 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SS18L2Q9UHA2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 C11orf68-201ENST00000438576 1619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SS18L2Q9UHA2 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
SS18L2Q9UHA2 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms