Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF12

PRODH2, Hydroxyproline dehydrogenase, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODH2Q9UF12 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PRODH2Q9UF12 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PRODH2Q9UF12 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
PRODH2Q9UF12 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PRODH2Q9UF12 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRODH2Q9UF12 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRODH2Q9UF12 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms