Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS3

DNAJB9, DnaJ homolog subfamily B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB9Q9UBS3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
DNAJB9Q9UBS3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
DNAJB9Q9UBS3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
DNAJB9Q9UBS3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DNAJB9Q9UBS3 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DNAJB9Q9UBS3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
DNAJB9Q9UBS3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
DNAJB9Q9UBS3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms