Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBJ2

ABCD2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD2Q9UBJ2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCD2Q9UBJ2 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCD2Q9UBJ2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ABCD2Q9UBJ2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ABCD2Q9UBJ2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ABCD2Q9UBJ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
ABCD2Q9UBJ2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ABCD2Q9UBJ2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
ABCD2Q9UBJ2 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
ABCD2Q9UBJ2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms