Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2X0

DPM3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DPM3Q9P2X0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
DPM3Q9P2X0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
DPM3Q9P2X0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DPM3Q9P2X0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DPM3Q9P2X0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
DPM3Q9P2X0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms