Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R7

SUCLA2, Succinate--CoA ligase [ADP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLA2Q9P2R7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUCLA2Q9P2R7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUCLA2Q9P2R7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SUCLA2Q9P2R7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SUCLA2Q9P2R7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SUCLA2Q9P2R7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
SUCLA2Q9P2R7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SUCLA2Q9P2R7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
SUCLA2Q9P2R7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
SUCLA2Q9P2R7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
SUCLA2Q9P2R7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 200.2 ms