Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
LRFN1Q9P244 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRFN1Q9P244 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRFN1Q9P244 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
LRFN1Q9P244 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LRFN1Q9P244 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LRFN1Q9P244 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms