Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0I2

EMC3, ER membrane protein complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC3Q9P0I2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EMC3Q9P0I2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
EMC3Q9P0I2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
EMC3Q9P0I2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
EMC3Q9P0I2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
EMC3Q9P0I2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
EMC3Q9P0I2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms