Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI6

TFCP2L1, Transcription factor CP2-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFCP2L1Q9NZI6 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.77■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
TFCP2L1Q9NZI6 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC34.75■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.72■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.71■■■■□ 3.15
TFCP2L1Q9NZI6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
TFCP2L1Q9NZI6 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TFCP2L1Q9NZI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
TFCP2L1Q9NZI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TFCP2L1Q9NZI6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TFCP2L1Q9NZI6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TFCP2L1Q9NZI6 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TFCP2L1Q9NZI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms