Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NLGN3Q9NZ94 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLGN3Q9NZ94 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLGN3Q9NZ94 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLGN3Q9NZ94 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN3Q9NZ94 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NLGN3Q9NZ94 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN3Q9NZ94 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms