Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXR8

ING3, Inhibitor of growth protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING3Q9NXR8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ING3Q9NXR8 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ING3Q9NXR8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ING3Q9NXR8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ING3Q9NXR8 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ING3Q9NXR8 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ING3Q9NXR8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms