Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
THUMPD1Q9NXG2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
THUMPD1Q9NXG2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
THUMPD1Q9NXG2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
THUMPD1Q9NXG2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD1Q9NXG2 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
THUMPD1Q9NXG2 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
THUMPD1Q9NXG2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113 ms