Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX24

NHP2, H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHP2Q9NX24 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NHP2Q9NX24 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
NHP2Q9NX24 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NHP2Q9NX24 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NHP2Q9NX24 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NHP2Q9NX24 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NHP2Q9NX24 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.9 ms