Protein–RNA interactions for Protein: Q9NWD8

TMEM248, Transmembrane protein 248, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM248Q9NWD8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM248Q9NWD8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
TMEM248Q9NWD8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
TMEM248Q9NWD8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM248Q9NWD8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
TMEM248Q9NWD8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
TMEM248Q9NWD8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TMEM248Q9NWD8 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TMEM248Q9NWD8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TMEM248Q9NWD8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
TMEM248Q9NWD8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TMEM248Q9NWD8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms