Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.57■■■□□ 2.65
FOXD4L1Q9NU39 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
FOXD4L1Q9NU39 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.51■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC31.47■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
FOXD4L1Q9NU39 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
FOXD4L1Q9NU39 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.61
FOXD4L1Q9NU39 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
FOXD4L1Q9NU39 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
FOXD4L1Q9NU39 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
FOXD4L1Q9NU39 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms